O Plano Estadual Amazônia Agora (PEAA) organiza-se em 4 Componentes Estruturais, ou Eixos, a saber:

• Fiscalização, Licenciamento e Monitoramento ambientais (usualmente denominado “Comando & Controle“);
• Ordenamento Territorial, Fundiário e Ambiental;
• Desenvolvimento Socioeconômico de Baixas Emissões de GEE;
• Financiamento Ambiental de Longo Alcance.

Além disso, o PEAA também possui 3 Componentes Transversais, cujos instrumentos vinculados funcionam como elementos de fortalecimento dos eixos principais e, além disso, como indutores dos ganho de escala, de eficiência e melhoria da governança e da governabilidade necessárias para o êxito do Plano:

• Comunicação, Transparência de Dados e Gestão Participativa;
• Infraestrutura e Logística para o Desenvolvimento Sustentável; e
• Tecnologia da Informação, Inovação e Pesquisa Científica e Tecnológica.